Pour ne garder que certaines pages d'un pdf :

pdftk document.pdf cat 1-5 8 output document_coupe.pdf

permet de ne garder que les pages de 1 à 5 et la page 8 du document.pdf dans le documents de sortie document_coupe.pdf

Pour éclater un pdf :

pdftk document.pdf burst

permet de récupérer chaque page du fichier documents.pdf dans des fichiers séparés sous le format pg_0001.pdf pg_0002.pdf etc.

Pour fusionner plusieurs fichiers :

pdftk document1.pdf document2.pdf cat output document_final.pdf